CO2 همچنین می تواند به عنوان ماده اولیه استفاده شود. با استفاده از Clostridium ljungdahlii ، Clostridium autoethanogenum یا Moorella sp می توان CO2 را با هیدروژن کاهش داد تا اتانول ، اسید استیک و مقادیر کمتری از ۲ ، ۳-بوتاندیول و اسید لاکتیک تولید کند.